Sorry for writing in Portuguese but it will be to help the guy.
Aqui para se ter uma ajuda precisa falar em ingles.
Faltou algumas informações para ajudar. Qual sistema tu esta usando? Depois de quando aconteceu esse problema?
Uma recomendação é baixar essa ultima versão 5.25 e começar do zero. Além de emuladores mais atualizados, tem varias opções a mais como video preview, função de conquistas. Só antes disso tenta preservar a pasta sua de save.
Uma segunda solução (a mais rapida) é fazer atualização atravez de linhas de comando via SSH. Eu utilizei o programa chamado putty.
Nele tu usa esse comando subistituindo o XX pelo seu aparelho exemplo rpi3 se for usar em uma raspberry pi 3:
batocera-upgrade https://batocera.org/upgrades/xx/stable/last
Caso não esteja seguro sobre isso pode por favor me informar qual o sistema esta usando? raspberry? pc?
