hola compi, instalacion nueva? a mi tambien me ocurrio, si puedes arranca un linux o gparted, y veras que te ha creado la particion /boot o batocera, pero sin embargo la /share que es donde irian todas las carpetas de configuraciones, roms, y demas, osea la particion grande no te la ha creado. formatea tu con gparted esa particion, ponla la etiqueta /SHARE, y listo, cuando arranques batocera, este ya montara esa partiion /share, y ya podras meter las roms, y modificar los ajustes de idioma y tal.
un saludo