Hola, tenía el mismo problema y esto fue lo que hice para solucionarlo: primero metes la BIOS del NeoGeo en la carpeta BIOS y en la carpeta de los roms, (NeoGeo.zip) una vez hecho, seleccionas la ROM que quieres correr y dejas presionado el botón para correrlo unos 3 o 4 segundos, aparece un menú donde seleccionas OPCIONES AVANZADAS DE JUEGO, una vez dentro vas a la opción EMULADOR, y seleccionas LIBRETRO/MAME078PLUS, en ese mismo menú hasta abajo viene la opción NeoGeo MODE allí seleccionas la opción que dice ARCADE MVS USA ahora vas a la opción VOLVER y corres nuevamente la ROM debe jalar sin problema, espero te sirva. Otra cosa importante según el tipo de tu ROM deberás seleccionar el modo NeoGeo es decir si es americana el MVS USA, si es japonesa el MVS JAPAN y así sucesivamente.